Vastasyntyneiden alloimmuuni- eli isoimmuunineutropenia esiintyy sikiöllä sikiön ja äidin neutrofiilien antigeenisen yhteensopimattomuuden vuoksi. Äidin isovasta-aineet kuuluvat IgG-luokkaan, ne tunkeutuvat istukan läpi ja tuhoavat lapsen neutrofiilit. Isovasta-aineet ovat yleensä leukoagglutiniineja, ne reagoivat potilaan ja hänen isänsä solujen kanssa, eivät äidin solujen kanssa.