Useimmissa tapauksissa ultraäänidoplerografian diagnostisessa käytössä se tulisi suorittaa yhdessä transkraniaalisen dopplerografian kanssa. Poikkeuksena tästä säännöstä ovat henkilöt, joilla on riittämättömästi ilmaistut tai kokonaan puuttuvat "ajalliset" ikkunat, sekä potilaat, joille transkraniaalinen dopplerografia on mahdotonta muista syistä (7-12 % potilaiden kokonaismäärästä).