Munuaisbiopsiaa käytetään munuaissairauden diagnosointiin ja hoitotaktiikan määrittämiseen. Diagnostista munuaisbiopsiaa käytetään sen jälkeen, kun muut, vähemmän invasiiviset instrumentaaliset menetelmät, kuten peräsuolen limakalvon, nenänielun, ihon ja imusolmukkeiden biopsia, on käytetty loppuun.