Troponiinikompleksi on osa lihasten supistumisjärjestelmää. Se muodostuu kolmesta proteiinista: troponiini T:stä, joka muodostaa sidoksen tropomyosiinin (molekyylipaino 3700) kanssa, troponiini I:stä (molekyylipaino 26 500), joka voi estää ATPaasin aktiivisuutta, ja troponiini C:stä (molekyylipaino 18 000), jolla on merkittävä affiniteetti Ca2+:aan.