Isännän RNA:n sisällyttäminen liittyy krooniseen hepatiitti E -infektioon.

Jos virus liittää isännän genomin segmenttejä geneettiseen rakenteeseensa, infektio voi muuttua krooniseksi.

• Miksi hepatiitti E muuttuu krooniseksi joillakin potilailla, ja miksi lääkkeet eivät tehoa?

Selvittääkseen asian kansainvälinen tutkijaryhmä, jota johtivat Bochumin tiedemiehet, tarkkaili kroonista E-hepatiitti-infektiota sairastavaa potilasta vuoden ajan. Viruksen RNA:n uudelleensekvensointi osoitti, että virus oli liittänyt isäntä-mRNA:n eri osia genomiinsa. Tämä johti replikaatioetuun, joka saattoi osaltaan vaikuttaa infektion kroonisuuteen.

• Isännän RNA:n liittyminen voi ennustaa siirtymistä akuutista infektiosta krooniseen tilaan

Dr. Daniel Todt, laskennallisen virologian tutkimusryhmän johtaja, lääketieteellisen ja molekyylivirologian laitos, Ruhrin yliopisto, Bochum, Saksa

Tutkijat raportoivat tästä Nature Communications -lehdessä.

• Viruspopulaation sekvensointi

Joka vuosi noin 20 miljoonaa ihmistä maailmanlaajuisesti saa hepatiitti E -tartunnan. Tartunta menee yleensä ohi ilman seurauksia, mutta se voi olla hengenvaarallinen raskaana oleville naisille tai heikentyneen immuunijärjestelmän omaaville henkilöille. Joissakin tapauksissa siitä tulee krooninen. Ei ole olemassa erityisiä tehokkaita lääkkeitä. Laajakirjoista viruslääkettä ribaviriinia käytetään myös hepatiitti E:n hoitoon, mutta se ei aina tehoa.

• Miten virus välttyy immuunijärjestelmältä? Miksi infektiosta tulee krooninen eikä se katoa?

Tutkijat ovat ensimmäistä kertaa analysoineet kroonisesti infektoituneen potilaan koko viruspopulaation yli vuoden ajan. He tarkastelivat yksityiskohtaisesti yli 180 yksittäistä verinäytteistä saatua sekvenssiä.

• Replikaatio soluviljelmässä isäntä-RNA:ta käyttäen

"Hepatiitti E -viruksen geneettisessä informaatiossa on niin sanottu hypervariaabeli alue, johon se voi liittää isäntäsolujen erilaisia RNA-sekvenssejä", Daniel Todt selittää. Hänen tiiminsä pystyi osoittamaan, että tämän alueen koostumus muuttui merkittävästi havaintojakson aikana. Lisäksi samanaikaisesti syntyi monia erilaisia koostumuksia. Soluviljelmäkokeissa osoitettiin, että isäntä-RNA:n liittäminen tarjosi replikaatioedun: modifioidut virukset pystyivät replikoitumaan paremmin kuin muut. "Oletamme, että tämä on osittain vastuussa infektion kroonisuudesta ja hoidon epäonnistumisesta", Daniel Todt sanoo.

• Virukseen sisällytetyn isäntä-RNA:n tutkimus

Tutkijat analysoivat virukseen sisällytetyn isäntä-RNA:n koostumusta selvittääkseen, oliko geneettisille segmenteille yhteisiä piirteitä. "Emme kuitenkaan löytäneet merkittäviä yhtäläisyyksiä", Todt sanoo. Sisällytetyt geenisekvenssit olivat enimmäkseen niitä, jotka ovat hyvin yleisiä isäntäsoluissa, mikä viittaa satunnaiseen valintaan.

• "On mahdollista, että hepatiitti E -infektion yhteydessä viruksen ja kehon immuunijärjestelmän välillä on kilpailu", Daniel Todt ehdottaa.

Jos virus onnistuu liittämään isäntä-RNA:n ennen kuin immuunijärjestelmä on hävittänyt infektion onnistuneesti, se voi johtaa krooniseen muotoon. "Viruksen genomissa oleva isäntä-RNA voi joka tapauksessa toimia biomarkkerina infektion akuutissa vaiheessa, mikä viittaa kroonisuuden varhaiseen todennäköisyyteen."

• Jatkotutkimuksen suunnittelu

Tutkijat aikovat laajentaa tutkimuksiaan suurempiin potilasryhmiin.