Krooninen hepatiitti B, jonka aiheuttaja on delta-virus, on useimmissa tapauksissa vakavampi kuin hepatiitti B ilman delta-viruksen komplisoitumista. On näyttöä siitä, että virustekijät (genotyyppi) voivat pitkälti määrittää taudin kulun. Yleisesti ottaen, toisin kuin kroonisessa hepatiitti B:ssä ja virushepatiitti C:ssä, joissa vähintään 70–50 % potilaista elää ilman maksakirroosia, 100 % kroonista virushepatiitti D:tä sairastavista potilaista kehittää väistämättä maksakirroosin 15–30 vuoden kuluessa tartunnasta ilman hoitoa.