Hemoglobiini E on kolmanneksi yleisin hemoglobinopatia (HbA:n ja HbS:n jälkeen), ja sitä esiintyy pääasiassa neekerirodun ihmisillä, amerikkalaisilla ja Kaakkois-Aasian alkuperää olevilla ihmisillä, kun taas se on harvinainen kiinalaisten keskuudessa.