Krimin verenvuotokuume erotetaan muista verenvuotokuumeista, influenssasta, leptospiroosista, meningokokkemiasta, lavantautista, kirurgisista sairauksista, joihin liittyy "akuutti vatsa" -oireyhtymä; sekä trombosytopenisesta purppurasta (Werlhofin tauti), jolle on tyypillinen subakuutti alkamisaika, lämpötilareaktion puute, verenvuotoinen ihottuma pienistä petekioista suuriin mustelmiin raajojen ja vartalon koukistajilla, tiheät nenäverenvuodot ja muut verenvuodot, hypokrominen anemia, leukosytoosi, trombosytopenia ja muutosten puuttuminen sydän- ja verisuonijärjestelmässä.