H. influenzae ovat gramnegatiivisia pleomorfisia sauvamaisia tai kokkoidisia soluja, joiden mitat ovat (0,2–0,3) x (0,5–2) µm. Ne sijaitsevat levitteissä yksittäin tai pareittain, ja joskus lyhyinä ketjuina ja ryhminä. Tiheällä alustalla ne muodostavat pieniä (halkaisijaltaan jopa 1 mm) pyöreitä, värittömiä pesäkkeitä. Mikro-organismit ovat liikkumattomia, eivät muodosta itiöitä, mutta kapselimuotojen muodostuminen on mahdollista, joihin liittyy patogeenisiä ominaisuuksia. Taudinaiheuttaja tuottaa endotoksiinia, jonka kantajaksi katsotaan kapselipolysakkaridit.