Sydänlihastulehduksen lääkehoidon pääsuunnat määräytyvät sydänlihastulehduksen patogeneesin pääasiallisten tekijöiden perusteella: infektion aiheuttama tulehdus, riittämätön immuunivaste, sydänlihassolujen kuolema (nekroosin ja etenevän dystrofian, sydänlihasperäisen kardioskleroosin vuoksi) ja sydänlihassolujen aineenvaihdunnan häiriintyminen. On otettava huomioon, että lapsilla sydänlihastulehdus esiintyy usein kroonisen fokaalisen infektion taustalla, josta tulee epäsuotuisa tausta (elimistön myrkytys ja herkistyminen), mikä edistää sydänlihastulehduksen kehittymistä ja etenemistä.