Hepatiitti B -viruksen elinkaaressa erotetaan kaksi jaksoa: viruksen replikaatiojakso, johon liittyy maksan tulehdusprosessin aktiivisuus, ja viruksen integraatiojakso, jonka aikana tulehdusaktiivisuus laantuu ja taudin remissiovaihe alkaa (inaktiivinen vaihe). Replikaatiovaiheen merkki on HBeAg.